Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms