Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms