Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms