Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms