Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms