Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms