Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms