Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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