Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Treml4Q3LRV9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Treml4Q3LRV9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms