Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd300lgQ1ERP8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms