Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms