Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms