Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms