Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms