Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fgfr4Q03142 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fgfr4Q03142 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms