Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms