Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms