Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2bQ01097 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms