Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms