Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gbx1P82976 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms