Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx1P80205 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms