Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx3P70354 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx3P70354 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Msx3P70354 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Msx3P70354 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Msx3P70354 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx3P70354 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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