Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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