Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms