Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp25P57080 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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