Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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PctpP53808 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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