Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 960 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms