Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ThpoP40226 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms