Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprkP35822 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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