Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rab5cP35278 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rab5cP35278 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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