Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp4P35123 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp4P35123 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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