Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms