Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms