Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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