Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms