Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prim1P20664 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prim1P20664 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prim1P20664 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prim1P20664 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms