Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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