Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ntf3P20181 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ntf3P20181 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ntf3P20181 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ntf3P20181 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ntf3P20181 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms