Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P20040 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P20040 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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