Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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