Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18533 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18533 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms