Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms