Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P10404 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P10404 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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