Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ifna9P09235 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms