Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01641 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01641 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01641 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms