Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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