Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms