Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DffaO54786 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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