Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Foxd2O35392 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxd2O35392 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.4 ms