Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Casq1O09165 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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